Seriál Akta X byl ukončen a Mulder a Scullyová jsou odděleni. Scullyová vyučuje na Akademii FBI v Quantiku ve Virginii, zatímco Mulder je přidělen ke sledování. S agentem Alexem Krycekem jako svým novým partnerem a záhadným X jako novým zdrojem informací se Mulder snaží udržet své pátrání po pravdě při životě. Paradoxně je to však Scullyová, kdo zažije blízké setkání, po němž Mulder toužil, a vydá se na cestu, která nakonec oba agenty opět sblíží a vytvoří pouto, které je sblíží jako nikdy předtím.