La terza stagione riprende subito dopo che Claire ha viaggiato attraverso le pietre per tornare alla sua vita nel 1948. Ora incinta del figlio di Jamie, lotta con le conseguenze della sua improvvisa ricomparsa che si ripercuotono sul suo matrimonio con il suo primo marito, Frank. Nel frattempo, nel 18° secolo, Jamie soffre per le conseguenze della storica battaglia di Culloden così come per la perdita di Claire. Separati da continenti e secoli, Claire e Jamie devono ritrovare la strada l'uno per l'altro. Come sempre, avversità, mistero e avventura li aspettano sulla via del ricongiungimento. E la domanda rimane: quando si incontreranno, saranno le stesse persone che si sono separate dalle pietre erette, tanti anni fa?